Realizace projektu ELI v České republice je podporována významnými českými institucemi:

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy je hlavním podporovatelem projektu na české úrovni. Jako financující agentura reprezentuje Českou republiku v rámci Mezinárodního řídícího výboru ELI-PP a finančně podporuje přípravu projektu ELI na národní úrovni.

V září 2008 Fyzikální ústav AV ČR podal jménem České republiky žádost o možnost stát se hostitelskou zemí ELI. Žádost obdržela plnou podporu ze strany české vlády (usnesení č. 2514 ze dne 24. listopadu 2008), která jmenovala náměstka ministryně školství, mládeže a tělovýchovy, prof. Vlastimila Růžičku, zplnomocněným zástupcem MŠMT pro tuto kandidaturu.

Akademie věd České republiky

Akademie věd České republiky je druhou financující organizací projektu na národní úrovni, která podpořila českou kandidaturu na laserové zařízení ELI. Spolu s Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy reprezentuje Akademie věd ČR Českou republiku v Mezinárodním řídícím výboru přípravné fáze projektu ELI.

Hlavním posláním Akademie věd ČR a jejích ústavů je podporovat základní výzkum v širokém spektru přírodních, technických a společenských věd. Ústavy Akademie věd se podílí na vzdělávacím systému, a to zejména výchovou mladých vědeckých pracovníků, poskytováním doktorandského studia a také pedagogickou činností svých pracovníků v rámci univerzit. Akademie rovněž spolupracuje s aktéry z oblasti aplikovaného výzkumu a průmyslu. Integrace české vědy v rámci mezinárodního kontextu je posílena četnými mezinárodními projekty a výměnnými programy mezi zaměstnanci AV ČR a mezinárodními partnerskými institucemi.

Konsorcium ELI-CZ

Konsorcium ELI-CZ sdružuje české univerzity a vědecké ústavy, jež mají zájem o projekt ELI. Vzniklo v lednu 2009 a dokládá silné partnerství mezi akademickými a výzkumnými institucemi a názorně demonstruje společný záměr vybudovat a provozovat mezinárodní laserové centrum ELI v České republice.

Základním cílem členů Konsorcia ELI-CZ je zavést nové vzdělávací programy (bakalářské, magisterské a doktorandské studium) v úzké návaznosti na vědecké parametry ELI a zvýšit informovanost národní akademické komunity nejen v rámci ELI, ale také v laserových vědách obecně.

Středočeský kraj

Středočeský kraj, zastoupený hejtmanem, vyjádřil svou podporu výstavbě výzkumné infrastruktury ELI. V říjnu 2008 bylo podepsané Memorandum o vzájemné podpoře a spolupráci při vybudování evropské výzkumné infrastruktury ELI v České republice.

Ministerstvo zahraničních věcí

Ministerstvo zahraničních věcí je další institucí, která vyjádřila svoji podporu realizaci projektu ELI v České republice, a jeho zástupci se aktivně podílejí především na prezentaci ELI v zahraničí.